В соответствии с Федеральным законом от 07.02.2011 № 9-ФЗ "Об упразднении некоторых районных судов Республики Саха (Якутия)" упразднены ряд районных судов Республики Саха (Якутия), в том числе Нижнеколымский районный суд Республики Саха (Якутия) и Среднеколымский районный суд Республики Саха (Якутия). Вопросы осуществления правосудия, относившиеся к их ведению, были переданы в юрисдикцию Верхнеколымского районного суда Республики Саха (Якутия).

В составе Верхнеколымского районного суда Республики Саха (Якутия) образованы постоянные судебные присутствия в поселке Черском Нижнеколымского района Республики Саха (Якутия) и городе Среднеколымске Среднеколымского района Республики Саха (Якутия) в соответствии с Федеральным законом от 31.12.2014 № 496-ФЗ "Об образовании постоянных судебных присутствий в составе некоторых районных судов Республики Саха (Якутия)".